En el archivo my
bind-address = IP_DEL_SERVIDOR

abrir el puerto en el servidor
iptables -A INPUT -i eth0 -p tcp –destination-port 3306 -j ACCEPT
o
iptables -A INPUT -i eth0 -s IP_REMOTA -p tcp –destination-port 3306 -j ACCEPT

comprobar
echo X | telnet -e X 162.243.160.43 3306

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